<html>
  <head>
    
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    <div class="moz-cite-prefix">Hi Christopher,<br>
      <br>
      this is a rather theoretical reply after looking into available
      literature which you surely also consulted (e.g. Butters et al
      2014 &amp; Balint et al 2016 on Plos One).<br>
      <br>
      Both papers basically say that the staining results are hard to
      predict and largely dependent on perfusion rates and tissue
      thickness (which of course is no surprise but pure chemistry and
      physics). Obvious issues effecting the scan results are
      over-staining or under-staining, and the optimal incubation time
      is hard to predict and depends on specimens size, tissue
      composition and - surely too - deposits in and on the specimens
      (the cholesterol you already noticed surely is one of the most
      obvious ones).<br>
      <br>
      Other influencing factor are is the x-ray source and data
      recovery.<br>
      <br>
      Personally (gut feeling rather then proofed experience), exposure
      to water based solutions for weeks or even months surely damages
      the specimens and weakens the tissues, and my next question would
      be what happens will all those (dissolved) fats in the specimens
      if they are immersed in water for such a long time. Also, Balint
      et al (2016) report that over-staining can lead to deformation and
      tissue shrinkage .<br>
      <br>
      The other method you mention, exposure to nearly 100% EtOH has
      just the effects that you describe, and the question for me is
      what would happen especially to those tissues near the body
      surface (e.g. in fish increasing the EtOH strength may cause cell
      rupture in the scale pockets and consequently may loosen the fish
      scales).<br>
      <br>
      So it might be worth to explore two alternatives:<br>
      <br>
      1. It might be worth to compare the imaging capacities of
      different ct-scanners; colleagues at the MNHN Paris for example
      used the synchroton in Geneva for imaging of or Lungfish larvae
      with amazing results.<br>
      <br>
      2. You mentioned that targeted specimens in your collection were
      preserved +100 yrs, some probably used pre-formalin fixatives. If
      this is the case, it might be worth to test if any mercury salts
      have been added. Balint et al (2016) mention, that "Mercury (II)
      chloride provide the best contrast between different soft tissue
      types".<br>
      <br>
      Around 1900, Mercury salts were not rarely added to enhance the
      "fixing" properties of the ethanol. Perhaps some of your specimens
      have already been treated with a contrast enhancing agent?<br>
      <br>
      Hope this helps, even though it is not a direct answer to your
      question.<br>
      All the best<br>
      Dirk <br>
      <br>
      <br>
      <br>
      Am 30.06.2017 um 19:59 schrieb Milensky, Christopher:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:ADAFD30E1B81B64685D5C38FF2C85D1D3C1E06F9@SI-MSEDAG01.US.SINET.SI.EDU">
      <meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered
        medium)">
      <style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:#0563C1;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:#954F72;
        text-decoration:underline;}
p
        {mso-style-priority:99;
        margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman",serif;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri",sans-serif;
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri",sans-serif;}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
      <div class="WordSection1">
        <p class="MsoNormal">Hello,<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal">I am hoping that some folks in the NHCOLL
          community have experience with iodine staining and would be
          willing to share their knowledge.  We are receiving more and
          more requests to use our fluid specimens (birds) for CT
          scanning projects, some of which require staining.  In the
          recent past, we have been asked to approve two different
          staining techniques.  One is a ‘water’ based staining method<span
            style="color:#1F497D">
          </span>and the other an ‘ethanol’ based method.  We would like
          to hear opinions about which method is best for the short and
          long term care of the specimens.  As with any old collection,
          the exact methods of fixation used over the last 100+ years
          have been variable, but typically our birds were fixed in
          formaldehyde and then moved to storage in 70% ETOH.  I’m sure
          some of our oldest specimens were never properly ‘fixed’ since
          formaldehyde did not come into use until the early 1900’s.<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal">The two methods:<o:p></o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p><span
            style="font-family:&quot;Calibri&quot;,sans-serif;color:black">I2KI
            (potassium iodine and iodide) is dissolved in water and
            makes a naturally antimicrobial solution in which the
            specimen is removed from ETOH storage and soaked for weeks
            to months, depending on the size of the animal, in this
            water solution.  Pickled tissues (fixed in formalin and
            preserved in 70% ethanol) should remain pickled even after
            being</span><span
            style="font-family:&quot;Calibri&quot;,sans-serif;color:#1F497D">
          </span><span
            style="font-family:&quot;Calibri&quot;,sans-serif;color:black">removed
            from preservative due to the chemical changes that occur
            during fixation, and iodine prevents bacterial growth, but
            it still involves putting a pickled specimen in water for an
            extended period. <o:p></o:p></span></p>
        <p><span
            style="font-family:&quot;Calibri&quot;,sans-serif;color:black"><o:p> </o:p></span></p>
        <p><span
            style="font-family:&quot;Calibri&quot;,sans-serif;color:black">I2E
            is elemental iodide dissolved in 100% ethanol (200 proof),
            which raises another set of issues for specimens stored in
            lower concentrations of ethanol. Increasing the
            concentration of ethanol further dehydrates and shrinks the
            specimen, but it has been found to be the most effective
            concentration of ethanol for staining soft tissues.<o:p></o:p></span></p>
        <p><span
            style="font-family:&quot;Calibri&quot;,sans-serif;color:black"><o:p> </o:p></span></p>
        <p><span
            style="font-family:&quot;Calibri&quot;,sans-serif;color:black">So,
            the question is:  Would you rather have a specimen removed
            from 70% and stored in a water/iodine solution for
            weeks/months or stored in 100% ETOH for a similar period or
            neither?  What are the pro/cons of each?  Would you allow a
            specimen collected pre-1910, and presumably not fixed, go
            into water/iodine for a month or more?  Are you aware of
            other methods?<o:p></o:p></span></p>
        <p><span
            style="font-family:&quot;Calibri&quot;,sans-serif;color:black"><o:p> </o:p></span></p>
        <p><span
            style="font-family:&quot;Calibri&quot;,sans-serif;color:black">I
            look forward to hearing your thoughts!<o:p></o:p></span></p>
        <p><span
            style="font-family:&quot;Calibri&quot;,sans-serif;color:black"><o:p> </o:p></span></p>
        <p><span
            style="font-family:&quot;Calibri&quot;,sans-serif;color:black">Chris<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><b><span
style="font-size:9.0pt;font-family:&quot;Arial&quot;,sans-serif;color:#1F497D">Christopher
              Milensky</span></b><span
style="font-size:9.0pt;font-family:&quot;Arial&quot;,sans-serif;color:#1F497D"><o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span
style="font-size:9.0pt;font-family:&quot;Arial&quot;,sans-serif;color:#1F497D">Collections
            Manager<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span
style="font-size:9.0pt;font-family:&quot;Arial&quot;,sans-serif;color:#1F497D"><a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__vertebrates.si.edu_birds_&amp;d=DwMFAg&amp;c=cjytLXgP8ixuoHflwc-poQ&amp;r=LpYc_Z_iN1KRw0hheb3x6-8MJUMu482qfHowpGYJqwc&amp;m=_ng57dMSlpRtwx104LoLynttAJTY-hHusbDzZvPHtcM&amp;s=GUIwF2jcK-a5sAF-jpiFUFCe2_UmI54Q-akmUeSa6xE&amp;e=" moz-do-not-send="true"><span style="color:blue">Division
                of Birds</span></a><o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><b><span
style="font-size:9.0pt;font-family:&quot;Arial&quot;,sans-serif;color:#1F497D">w</span></b><span
style="font-size:9.0pt;font-family:&quot;Arial&quot;,sans-serif;color:#1F497D">
            202.633.0794 
            <a href="mailto:milenskyc@si.edu" moz-do-not-send="true">milenskyc@si.edu</a><o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span
style="font-size:9.0pt;font-family:&quot;Arial&quot;,sans-serif;color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span
style="font-size:9.0pt;font-family:&quot;Arial&quot;,sans-serif;color:#00C1D5">SMITHSONIAN
            INSTITUTION<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span
style="font-size:9.0pt;font-family:&quot;Arial&quot;,sans-serif;color:#00778B">NATIONAL
            MUSEUM OF NATURAL HISTORY<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="color:#1F497D"><a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__www.facebook.com_nmnh.fanpage_&amp;d=DwMFAg&amp;c=cjytLXgP8ixuoHflwc-poQ&amp;r=LpYc_Z_iN1KRw0hheb3x6-8MJUMu482qfHowpGYJqwc&amp;m=_ng57dMSlpRtwx104LoLynttAJTY-hHusbDzZvPHtcM&amp;s=X7g2ygbeq4Qk8rRPJNvvu2eiKjssqOkwDsEpSsYEtGQ&amp;e=" moz-do-not-send="true"><span
style="font-size:9.0pt;font-family:&quot;Arial&quot;,sans-serif;color:black;text-decoration:none">Facebook</span></a></span><span
style="font-size:9.0pt;font-family:&quot;Arial&quot;,sans-serif;color:#1F497D"> 
            | <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__twitter.com_NMNH&amp;d=DwMFAg&amp;c=cjytLXgP8ixuoHflwc-poQ&amp;r=LpYc_Z_iN1KRw0hheb3x6-8MJUMu482qfHowpGYJqwc&amp;m=_ng57dMSlpRtwx104LoLynttAJTY-hHusbDzZvPHtcM&amp;s=KZVJ2cbz-SfsWP_fnu5OI09vzY7-qmmMTWRBriqgDX8&amp;e=" moz-do-not-send="true"><span style="color:blue"> Twitter </span></a> | 
            <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=https-3A__www.instagram.com_smithsoniannmnh_&amp;d=DwMFAg&amp;c=cjytLXgP8ixuoHflwc-poQ&amp;r=LpYc_Z_iN1KRw0hheb3x6-8MJUMu482qfHowpGYJqwc&amp;m=_ng57dMSlpRtwx104LoLynttAJTY-hHusbDzZvPHtcM&amp;s=I7Q6DzgLwZ6q-fy1iRe8eLsvKV25KW_DrwWfIqKSlpQ&amp;e=" moz-do-not-send="true"><span style="color:blue">Instagram</span></a></span><u><span
              style="color:blue"><o:p></o:p></span></u></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
        <p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
Nhcoll-l mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:Nhcoll-l@mailman.yale.edu">Nhcoll-l@mailman.yale.edu</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://mailman.yale.edu/mailman/listinfo/nhcoll-l">http://mailman.yale.edu/mailman/listinfo/nhcoll-l</a>

_______________________________________________ 
NHCOLL-L is brought to you by the Society for the Preservation of
Natural History Collections (SPNHC), an international society whose
mission is to improve the preservation, conservation and management of
natural history collections to ensure their continuing value to
society. See <a class="moz-txt-link-freetext" href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__www.spnhc.org&d=DwMD-g&c=cjytLXgP8ixuoHflwc-poQ&r=LpYc_Z_iN1KRw0hheb3x6-8MJUMu482qfHowpGYJqwc&m=smGagMePxFozcXGKahjzLhpdcARsvbynio79hX7WTy8&s=edvqM1Sb3199E_wM8vxo71DdPBAgKCghsMENYkzpAyQ&e=">http://www.spnhc.org</a> for membership information.
Advertising on NH-COLL-L is inappropriate.
</pre>
    </blockquote>
    <p><br>
    </p>
    <pre class="moz-signature" cols="72">-- 
Dirk Neumann

Tel: 089 / 8107-111
Fax: 089 / 8107-300
email: Dirk.Neumann(a)zsm.mwn.de

Postanschrift:

Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns
Zoologische Staatssammlung München
Dirk Neumann, Sektion Ichthyologie / DNA-Storage
Münchhausenstr. 21
81247 München

Besuchen Sie unsere Sammlung:
<a class="moz-txt-link-freetext" href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__www.zsm.mwn.de_ich_&d=DwMD-g&c=cjytLXgP8ixuoHflwc-poQ&r=LpYc_Z_iN1KRw0hheb3x6-8MJUMu482qfHowpGYJqwc&m=smGagMePxFozcXGKahjzLhpdcARsvbynio79hX7WTy8&s=yXNWVYw49-2AJ2lff06zPyzZUASyoxes-3sSGzIbo0Y&e=">http://www.zsm.mwn.de/ich/</a>

---------

Dirk Neumann

Tel: +49-89-8107-111
Fax: +49-89-8107-300
email: Dirk.Neumann(a)zsm.mwn.de

postal address:

Bavarian Natural History Collections
The Bavarian State Collection of Zoology
Dirk Neumann, Section Ichthyology / DNA-Storage
Muenchhausenstr. 21
81247 Munich (Germany)

Visit our section at:
<a class="moz-txt-link-freetext" href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__www.zsm.mwn.de_ich_&d=DwMD-g&c=cjytLXgP8ixuoHflwc-poQ&r=LpYc_Z_iN1KRw0hheb3x6-8MJUMu482qfHowpGYJqwc&m=smGagMePxFozcXGKahjzLhpdcARsvbynio79hX7WTy8&s=yXNWVYw49-2AJ2lff06zPyzZUASyoxes-3sSGzIbo0Y&e=">http://www.zsm.mwn.de/ich/</a>



</pre>
  </body>
</html>