<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"><div dir="ltr">Counting fish and measuring (smallest and largest) specimens in each jar has become part of our standard procedure. Unfortunately it is one of the most time consuming steps in our workflow. I am looking for ways of speeding this up. Has anyone tried using counting apps like CountThings (<a href="https://countthings.com/en/">https://countthings.com/en/</a>). I tried it and was not initially impressed - counts were way off. But, they are now developing a fish specimen counting template based on ~50 specimen images I sent them. So now I am starting to seriously consider how we might include this in our workflow. Are there other apps out there being used to count specimens? Are they accurate?<div><br></div><div>Perhaps there are programs out there that allow automated measuring of specimens based on images of specimens that also include a scale bar? I started exploring ImageJ (<a href="https://imagej.nih.gov/ij/index.html">https://imagej.nih.gov/ij/index.html</a>), which does this via a multi-step (multi click) process and unless it can be applied in bulk somehow, I think it will take more time than using calipers by hand. I see there are a bunch of plugins that I have not begun to explore.</div><div><br><div>To date our counting and measuring has always preceded cataloging so that we can get those data included in the database and printed on our formal jar labels. I am now imagining, cataloging and leaving those fields empty initially while we photograph the contents of each jar, developing an archive of images. Then, periodically we could apply a procedure to the images in bulk that would extract counts and ideally measures.<br><div><div><br></div><div>I'd be interested in any thoughts about any aspect of this topic.<br></div><div><br></div><div>Adam<br clear="all"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><p><span style="font-size:10pt;font-family:Tahoma,sans-serif;color:black">-------------------------</span><span style="color:black"></span></p><p><span style="font-size:10pt;font-family:Tahoma,sans-serif;color:black">Adam E. Cohen<br>Ichthyology Collection Manager<br></span><a href="https://biodiversity.utexas.edu/collections" target="_blank">Biodiversity Collections</a> (Texas Natural History Collections), <span style="font-size:10pt;font-family:Tahoma,sans-serif;color:black">University of Texas,</span></p><p><span style="font-size:10pt;font-family:Tahoma,sans-serif;color:black">10100 Burnet Rd., PRC176/R4000<br>Austin, Texas 78758-4445 U.S.A.<br><br>Phone: Cell: 512 970 2479 | Office: 512 471-8845 | Lab: 512 471-4823</span><span style="color:black"></span></p><p><span style="font-size:10pt;font-family:Tahoma,sans-serif;color:black">Websites: <a href="https://biodiversity.utexas.edu/collections/ichthyology" target="_blank">TNHCIchthyology</a> | <a href="http://www.fishesoftexas.org/home" target="_blank">Fishes of Texas</a></span></p></div></div></div></div></div></div></div></div>